Göztepe, Beşiktaş’ı son olarak 2001-2002 döneminde siyah-beyazlıların eski stadyumu olan İnönü’de 2-1’lik skorla mağlup etti. O tarihten sonra İzmir ekibi, Beşiktaş deplasmanında puan veya puanlarla dönmeyi başaramadı. 27 Nisan 2001 tarihinde kazandığı maçın ardından Beşiktaş’la İstanbul’da 7 resmi maça çıkan Göztepe, tüm müsabakaları kaybetti. Sarı-kırmızılılar, 2002-2003 döneminde Beşiktaş’a konuk olduğu maçta rakibine 7-3’lük skorla mağlup oldu.Uzun bir aradan sonra Süper Lig’e dönüş yapan Göztepe, 2017-2018 sezonunda siyah-beyazlılara İstanbul’da 5-1 mağlup oldu. Bir sonraki sezon 2018-2019 döneminde oynanan karşılaşmayı da 1-0 kaybeden İzmir ekibi, 2019-2020’de de deplasmanda bu kez 3-0’lık skorla yenildi. Göztepe 2020-2021 ve 2021-2022 sezonlarında Beşiktaş ile deplasmanda oynadığı maçları 2-1’lik skorlarla kaybetti.
