Masa vantilatörleri genellikle güvenli kabul edilse de, dikkat edilmediğinde büyük kazalara davetiye çıkarabilir. Özellikle çocuklar ve evcil hayvanlar için risk taşıyan bu cihazlar, hızlı dönen pervaneleriyle ciddi yaralanmalara yol açabilir. Parmak sıkışmaları, gövdeye temas eden keskin kanatlarla oluşan kesikler ya da elektriksel arızalar, masa vantilatörlerinin dikkat edilmesi gereken tehlikeleri arasında.
